计算生物学中心开发了新的和创新的方法来检查生物科学中的数据,其规模和复杂性在历史上一直抵制分析。
CCB的任务是开发理解生物过程的建模工具和理论,并创建计算框架,使分析由新的实验技术产生的大型复杂数据集成为可能。
研究领域
协同工作
即将来临的事件
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12星期四 - 讨论会下午一时至二时三十分
CCB研讨会:Pratyush Tiwary,博士(马里兰大学)
- 讨论会下午一时至二时三十分
出版了
使用Cryo-EM粒子进行集成重加权
低温电子显微镜(cryo-EM)最近成为获得生物大分子高分辨率结构的主要方法。然而,它是有限的……
arXiv: 2212.05320并发ARFI斑块成像和人颈动脉壁剪切应力测量,并通过流体结构相互作用模型验证。
Keerthi S. Anand,大肠Kolahdouz等。
动脉粥样硬化斑块的破裂潜力取决于斑块的成分和它所遇到的剪切应力。
IEEE国际超声研讨会一个隔离的美国新兵训练中心的SARS-CoV-2暴发动态,并采取严格的预防措施
朗达·a·莱泽夫斯基,r . Sealfon,o . Troyanskaya等。
海军陆战队新兵在帕里斯岛训练时,严重急性呼吸综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2)感染率意外地高,…
流行病学导演
软件

阿伦
这是用于跟踪由马达蛋白驱动的微管组件的模拟工具。

STKFMM
这是一个用于边界积分方法中Laplace和Stokes算子的各种单层和双层核的数值计算包,在高度优化的核无关快速多极方法包PVFMM的基础上实现。

humanbase
人类基因表达、功能、调控和相互作用的数据驱动预测。

深海
基于深度学习的预测染色质效应的算法框架

FNTM
小鼠组织的功能网络

巨大的
144种人类组织和细胞类型的全基因组尺度功能相互作用网络

小鬼2.0
综合多物种预测

KNNimpute
k -最近邻Imputation

Nano-Dissection
该服务器在硅纳米解剖中执行,这是我们开发的一种方法,用于识别具有新的细胞谱系特异性表达的基因。

寻求
基于搜索的表达纲要探索[人]

SkellySim
SkellySim是一个模拟包,用于模拟细胞组件,如柔性纤维、运动蛋白和任意刚体。

麋鹿
计算功能基因组学Sleipnir库

大熊星座(高清)
以数据驱动的视角分析人类组织和疾病的基因表达谱。